混元禪師更認為易經包含著「宇宙神理的奧秘」，契入研究的角度雖有不同，但是混元禪師以其智慧，應用在日常生活中，不論是人生哲學、生活智慧，給有緣眾生無限希望，猶如暗夜眀燈，照亮眾生心中的黑暗。 2008年，美術產業發展學系改名美術產業學系；自然科學教育學系改名應用科學系（分設應用物理組、化學暨奈米科學組）。 2003年8月1日，為平衡東臺灣高等教育資源之不足，遂改名為國立臺東大學，為臺東縣唯一的大學、綜合大學及國立大學，設有師範學院、人文學院、理工學院。 國立臺東體育實驗高級中學改隸國立臺東大學為國立臺東大學附屬體育高級中學。 其後，並曾設置暑期二年制國校師資科、三年制普通師範科等，辦理在職國民小學教師的進修教育，以提昇其專業及專門知能，提高其教學品質。 曾名「台南科技大學」，因為校名與「南臺科技大學」過於相似，易使公眾混淆，再加上南臺科大也曾申請相同校名，不料遭到教育部以「地名應予公立學校使用」為理由駁回，但是卻允許「台南女子技術學院」更名，有違公平原則。
至今已有9屆共約1千多位大專學生接受易經風水學妙法的啟蒙。 旁邊有葫蘆池，「金丹葫蘆」圓拱形的長生橋，幾株垂柳，又是另一個禪機的示現。 再往前走就是如來園接引眾生的是北魏石刻的四大天王，如來園中間供奉著唐朝大佛石雕像，座下有世界最大的羅盤，與四周山形完全相應，如來園四周則有五百羅漢石雕神像，每尊表情、儀態、所執法器完全不同，混元禪師開示五百羅漢的擺設佈置? 00眾生1佛心的意境，相傳若要求子，只要夫妻二人一起誠心將五百羅漢的頭一尊一尊摸完即可得子，據說非常靈驗。
資訊教育學系分拆為資訊管理學系、資訊工程學系。 2011年，因為校名爭議事件，被迫改名台南應用科技大學，法人登記全銜為台南家專學校財團法人台南應用科技大學。 應用設計研究所與視覺傳達設計系系所合一為視覺傳達設計系暨碩士班。 2011年：台北淡水校區正式定名台北校區、台南麻豆校區正式定名台南校區。 航空服務管理學系改名航空運輸管理學系、運動事業經營學系改名運動健康與休閒學系。
唯心聖教大學: 台南校區
2000年8月，增設四年制國際企業經營系、美術系、舞蹈系；增設二年制國際企業經營系、舞蹈系；增設二年制修部在職專班美容造型設計系。 1970年6月，增設音樂科，分設鍵盤組、聲樂組、弦樂組、管樂組。 同年11月，家庭工藝科改名美術工藝科，並分設應用美術組、工藝設計組。
1948年2月，教育部鑑於其教育目標及課程設備等均與普通中學不同，乃將兩校附設之簡師班合併，正式成立「臺灣省立臺東師範學校」。 同年8月增設「普通師範科」，招收初中畢業生，修業三年；同時並商得臺東縣政府同意，撥用臺東市中華路一段臺東校區現址建校。 其後，為因應山地學校師資不足及地方教育發展之需要，曾辦過供原住民籍國民學校畢業生就讀的一年制補習班，及招收高中（職）畢業生的一年制「教育學科選修班」、「特別師範科」等。 國立臺東大學（簡稱東大、NTTU），是一所位於臺灣臺東縣臺東市的綜合型國立大學，前身為1948年創立的臺灣省立臺東師範學校。 知本校區廣達60公頃，該校現主要發展、行政單位及所有學院系所等，皆設立於知本校本部。
唯心聖教大學: 國立臺東大學學生會
混元禪師以音樂之美、庭院之美、內涵之美、藝術之美、文化之美、宗門之美，孕育每一位唯心聖教弟子，希望唯心聖教弟子胸藏萬物，時時以眾生為念。 台灣是一塊寶地，有著屬於這個地區的特有文化。 混元禪師在台灣地區因應民情需要，將鬼谷子心法融合佛法智慧，為眾生解決生活上的諸多疑難。 並將北中南地區因民俗不同所產生的異文化，做了中庸而合理的開示及應用。 詳實的紀錄著台灣當代居住文化（風水學概念）、民俗風情（台灣的婚喪喜慶、民俗喜忌）的轉變。 文化是人類生活的經驗與智慧的傳承，坐落於南投縣國姓鄉的禪機山仙佛寺唯心聖教道場，正秉持著中國人的智慧文明，默默耕耘，並由教主混元禪師高樹法幢，講經說法，師承鬼谷子，應用易經的哲思、智慧，普潤群黎。
- 社區弘法為區域性傳法，信眾藉此更直接、更親近大師風采，而風水學理的記憶也更為深刻。
- 1946年，第二次世界大戰結束後，中華民國國民政府為了發展地方教育，在省立臺東中學及臺東女中各附設「簡易師範科」一班，招收國民學校畢業生，修業四年。
- 文化是人類生活的經驗與智慧的傳承，坐落於南投縣國姓鄉的禪機山仙佛寺唯心聖教道場，正秉持著中國人的智慧文明，默默耕耘，並由教主混元禪師高樹法幢，講經說法，師承鬼谷子，應用易經的哲思、智慧，普潤群黎。
- 有關馬偕的個人物品是從牛津學堂史蹟館移過來，其他文物則從淡水長老教會及其他教會借來展示。
- 2008年成立「世界和平促進會」，運用易經與風水學妙法，促進大眾生活安和樂利，教育大眾居住空間與大自然的協調，創造人類幸福安定生活，達到世界和平的目標。
- 2002年6月，增設音樂研究所，為該校第一個研究所。
1965年1月23日，台南家政專科學校（簡稱台南家專）奉准立案招生，設立五年制家政、服裝設計及會計統計三科。 教士會館：建於1875年，為馬偕博士所設計的西班牙風格建築，其時用作宣教師宿舍，近代作為前校長公館，現已規劃為真理大學教士會館，作為紀念在台宣教士之用外，也提供餐飲，文化導覽，藝文空間等服務。 馬偕故居：又稱小白宮，建於1875年，為馬偕博士所建的西班牙風格建築。 馬偕故居在二次世界大戰時，教會曾設安樂家，以收留失依婦女，爾後成為淡江中學男生宿舍。 戰後，偕叡廉再度回淡水居住於此至1952年止。 1965年真理大學創校後，馬偕故居輾轉成為圖書館、實習旅館和學人招待所，而馬偕家族返台時也會下榻於此。
禪機山背靠九份二山，面對著九九峰，在群山環繞中更顯得清幽恬適。 各景點都有其獨立之生命，拾天梯而上，兩旁松樹伸出佛手來迎接眾生，在天梯的盡頭，佇立著一個盤古存蹟『福龜迎賓』，前有九曲橋蜿蜒在天池上，而雄偉壯觀的「山門」佇立其上。 一進山門典雅莊嚴的大雄寶殿就在眼前，大雄寶殿的設計具有無上的禪機，大殿建築的上方雙手合掌禮敬天地，? 傿蛢野肣n更謙卑，也讓人心靈立刻沈澱下來，大殿內供奉鬼谷仙師王禪老祖、阿彌陀佛、觀世音菩薩。
中如意康福拳會養生功，台中薰風合唱團，本教大專班舞蹈･･････多元而融合的藝術之美，是人們內心安詳的本源。 混元禪師以出世的慈悲願力、入世的金剛願行、人間的藝文之美，感動人心。 庭園景觀示現小宇宙之美，禪機山庭園景觀以易經風水法則建造，融入自然，賞心悅目；為讓更多學子參與，進而細細體察，於是舉辦中、小、幼兒學生寫生比賽、成人攝影比賽，讓庭園之美，進入每個參賽者的心底。
10月，增設二年制日間部美容造型設計科、五專部財務金融科、五專部商品設計科、二年制進修部美容造型設計科。 停招二技日間部音樂系、二技進修部服飾設計管理系、音樂系、會計資訊系。 1999年2月，增設二年制進修部在職專班家政系、會計系、服飾設計管理系、音樂系、室內設計系、美術系。
因而思想學家將社會人心的需要，轉化為希望的理想世界，並將之融入當代生活。 「佛法在世間，不離世間覺」，混元禪師廣讀聖賢書，藉由不斷的應證、探索，發展出適應眾生需要的一種言詞、態度及方法，觀機逗教，解除眾生迷惑，如活佛在世。 易經素有「上知天文，下知地理，中通人事」的不可思議能力。 所謂：「人法地，地法天，天法道，道法自然。」古人無不窮經皓首研究，故易經素有群經之首的超凡意義。
該校以發展卓越教學與特色研究的綜合型大學為目標，並積極朝向優質的教學型以及研究型大學發展。 2012年，商學與管理研究所併入國際企業經營系為碩士班。 生活應用科學研究所與生活服務產業系系所合一為生活服務產業系暨生活應用科學碩士班。 2016年：台南校區停招運動健康與休閒學系、旅遊文化與健康產業學士學位學程、觀光暨服務產業學士學位學程。 2012年：台北校區觀光休閒事業學院與台南校區運動知識學院整併為觀光休閒與運動學院。
而佛教中諸多經典都是世尊親口宣說，宜多讀誦薰習，進入八識田中，念佛、憶佛，佛自在。 混元禪師了知世間因緣法，即如王禪老祖八寶心法－－「來者不拒、去者不留，不可勉強，有緣則度、有德則助，皆順天理、事事如意。」萬事隨緣，萬緣放下，順天理，盡人事，在哈哈大笑中渡盡眾生煩惱。 人類生存所需要的不外是生存條件，而「水」是不可或缺的。
停招數理科學研究所，改招統計與精算學系碩士班。 停招管理科學研究所，改招企業管理學系碩士班（含碩士在職專班）。 2004年，增設區域政策與發展研究所、生命科學研究所、公共事務管理碩士學位在職進修專班、英美語文學系。 數理教育學系改名數學學系，自教育學院改隸理工學院。
2016年5月28日，真理大學在該建築內成立馬偕紀念館，參觀人潮絡繹不絕、風光一時，但2020年後校方因故決定關閉紀念館，並不對外開放民眾參觀。 1959年2月14日：謀設高等教育事業以對社會提供更積極之貢獻，並期於日後興辦綜合大學為目標。 推舉蔡培火先生為召集人，定校名為靈光理學院，並計畫開辦數學、生物、護理、家政及化學五學系。。 該校校史悠久，可追溯至1872年3月9日加拿大基督教長老教會宣教師馬偕登陸淡水，選定現址（今真理大學淡水校區）興建校舍以作傳教、教育及醫療之用。
禪機山是混元禪師弘法利生的開山道場，也是台中精修院因場地不敷使用後而闢建；許多信眾因道場的建設而凝聚心力，因道場的建設而心靈有所依止，也因為如此，混元禪師法緣更加寬廣，十方善信紛杳而至。 民國九十七年，世界性的經濟風暴，使台灣經濟受到衝擊，新聞媒體每天播放經濟衝擊後的社會現象、人心的不安，於是「愛心團」針對社會經濟變化而產生的不安，以「物資救助」－－每戶一桌普桌供品。 混元禪師認為「人可以不相信風水，但人卻無法離開風水而生活在風水中」，又說：「風和水，是宇宙大元素、人類生活基本法則」、「盈天地間者，風與水也」。 因此，風水學所強調的就是環境學，在不同的大環境中，如何融入並相互共存，是混元禪師「天人合一」理念之一環。 風水是宇宙調和的法則，所謂「風調雨順，國泰民安」。
及旅館管理學位學程；增設二技在職專班銀髮生活產業學位學程、課後照顧學位學程。 停招五專部家政科、會計科、國際貿易科、財務金融科及室內設計科；停招二專部美容造型設計科；停招二技進修部國際企業經營系、財務金融系；停招生活科學系。 2001年8月，增設四年制舞蹈系、二年制進修部在職專班美容造型設計系。 2009年8月由西班牙網路計量研究中心網路實驗室發表之世界大學網路排名 （页面存档备份，存于互联网档案馆），6000多所學術單位中，真理大學排名世界第1635名。 2010年1月由西班牙網路計量研究中心網路實驗室發表之世界大學網路排名 （页面存档备份，存于互联网档案馆），8,000多所研究與學術單位中，真理大學排名世界第1593名。
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