自2003年起，製作單位以「數位修復特別版」為名，重製部分低畫質的集數，並於原播放時段不定期重播單集時間1至2小時特別版、單一事件長度為3集特別單元，以及其他經典、精彩代表集數。 2022年，宣布新作中篇動畫「合奏比賽篇」將於2023年發售藍光光碟及劇場上映，電視動畫第3期「久美子三年級篇」將於2024年播放。 2017年9月30日，以電視動畫第2期的部份內容為基礎，加上新增內容的動畫電影《吹響吧！上低音號——想要傳達的旋律》在日本上映，最終票房1億3400萬日圓。 2016年4月23日，電視動畫第1期總集篇，由松竹公司發行的動畫電影《吹響吧！上低音號——歡迎來到北宇治高校吹奏樂部》在日本上映，最終票房2億3000萬日圓。 同年10月至12月，電視動畫第2期《吹響吧！上低音號2》開始放送。
雖然動畫版的劇情和漫畫相同，但不知為何此兩集的順序對調，這會導致沒看過漫畫的觀眾誤以為麻醉園子只是因為小五郎不在場而隨便麻醉他人。 二是在動畫版片尾，柯南的一句「三年後」引發不少非議。 元太，光彦，步美初登場於漫畫第2卷，動畫更改為第1話、見過新一。 日本警察機關的中樞要地警視廳本部之內竟然發生了挾持人質事件！ 人質包括警視總監田丸、副總監長谷川及各部部長共十二名要人。
亦避免動畫版全面追上漫畫進度，導致影響青山剛昌的創作，故不定期排定數位重播。 2016年底，為了紀念「名偵探柯南20週年動畫&劇場版」，在週刊少年SUNDAY上公布特別篇「名偵探柯南 Episode”ONE ”變小的名偵探」播放消息，並在當年12月9日於「金曜日RoadShow」上播出。 從第1集的「新一弄壞了小蘭手機、約在遊樂園見面的地方」開始，有每個人在相同時間點做些不同事情的劇情。 2014年底，上述兩家電視台為紀念原作漫畫連載20週年而製作電視動畫特別篇《江户川柯南失蹤事件～史上最糟糕的兩天～》。 2009年，日本電視台和讀賣電視台分別為慶祝55週年、50週年台慶，共同製作跨作品的電視動畫特別篇《魯邦三世VS名偵探柯南》。
劇場版2: 電視動畫
此外2016年8月与9月还发表了《吹响！上低音号～欢迎来到立华高中管乐团～》的前后篇。 本旅遊篇原預定2016年的神秘之旅結束後播放，但因為受到熊本地震造成大分縣建築物受損而導致此次神秘之旅延長到次年2月。 本集原畫組由4tune外包制作，這也是《名偵探柯南》TV動畫史上首次由中國大陸外包公司承擔大規模原畫制作工作。 由於遭受2019冠狀病毒病疫情的波及，劇場版被迫延期一年上映，本集亦隨之順延播出時程。
人質所在的會議室已經被機動隊和特殊行動組SIT完全包圍，可犯人卻一直沒有動靜，甚至沒有提出任何要求。 《吹響吧！上低音號——歡迎來到北宇治高校吹奏樂部》獲選為第20回文化廳媒體藝術祭「動畫部門・審査委員會推薦作品」。 花田表示他在创作剧本时一般会把对话写的有条不紊而且富有逻辑性，这在后期录音时，音响导演鹤冈阳太便曾不时指出了这样不太符合女高中生风格，所以在创作时会反向思考。 同时为将对话变得有青春和随意感，这项任务便交给了具有这方面才能的山田，这方面石原认为山田虽然身为女性但十分喜欢高中女生。
2008年之後，更開始協助推廣以JR西日本為主體的地方旅遊活動。 神秘之旅活動結束後，《名偵探柯南》本篇故事就會播出主角們搭乘同公司的列車展開旅行，並以開始一段以當地為背景發生案件的原創故事。 在2016年前，旅遊特别篇均在神秘之旅發起的同年播。 從2016年開始，由於神秘之旅延長至次年1–2月結束（其中2016年的神秘之旅因熊本地震而延長），故所對應的旅遊特别篇亦改為於次年播出。 2022年，為了紀念《名偵探柯南：萬聖節的新娘》上映，因此特別製作聯動總集篇《總局刑警戀愛物語-結婚前夜》，並於劇場版上映當日(4/15)起連續兩週於「金曜日RoadShow」上播出。
劇場版2: 劇場版
原作中出现了带有宇治地方音的京都方言，但在动画中都改为了标准的日本语。 《吹响吧！上低音号》（下文简称《吹响》）的动画第1期由曾执导了Key社系列动画化作品、《凉宫春日的忧郁》等作品的石原立也担任导演，以及导演了动画《轻音》和电影《玉子爱情故事》并有获奖史的山田尚子出任系列演出。 祖父是著名吹奏乐指导者，似乎由于不想与祖父扯上关系而选择就读祖父不在的北宇治高中，也不喜欢别称呼他的姓氏。 由于没有系统性的教导，演奏技术上有不太好的习惯。 從小於父親要求下開始吹奏小號，上高中決定在管樂團繼續吹奏下去。
日本深夜動畫：下文記載的日本国内播放時間使用日本標準時間（UTC+9）表示。 因為部分時間可能會採用30小时制，因此請留意其實際播放時間為翌日清晨。 石原立也谈到《吹响》动画第1期在制作初期风格处于探索阶段。 因为原作属于比较纯粹的小说，而动画的播放定档在以动画爱好者为受众的深夜播出，所以一开始在制作时偏向了搞笑风格。 最后在探索中形成了以“描绘全力以赴地进行社团活动的高中生”的追求真实性的风格。 在石原眼中学生时代是“人们一生中最美好和精彩的时期”，身心也会发生很大变化，所以他内心有去描绘小说中这群少女们的内心活动以及其中的微妙之处的想法。
自2003年起，在正常放送時段會不定期播出過去的劇情，並以「重播特別篇」或「數位修復特別版」為題進行重播。 從2007年到2009年初，則以3集的長篇單元剪輯成1集重播為主。 在播出時段移動過後（2009年4月4日起，即从数字修复重映第1话「云霄飞车杀人事件」开始），決定以「數位修復特別版」為題製播，並以單集重播為主。 而自1999年以來在電視上不定期播出過往的劇場版，在2003年推出數位修復版之後漸漸從正常放送時段轉至非正常放送時段，如星期五的「金曜日Roadshow」等，但在新1部劇場版上映之前會重播過往劇場版的傳統仍然不變。 此外，在特殊情况下，数字修复版也用以填补正式剧集无法如期播出的空档。
2015年4月以小说首作为基础，京都動畫制作、石原立也监督的的同名電視動畫開播。 2016年4月23日劇場版動畫電影公開上映，內容為電視動畫的總集篇。 2017年9月30日將上映第2期动画的总集篇的劇場版。
過去收視率長期高居日本動畫收視率前10名，在台灣播出時的收視率亦高居動畫類前幾名。 至2021年3月已播出1000話，每年可能會播出1至2集、時間為1到2.5小時不等長篇特別篇，但近年因時間難以調動而幾乎沒有長篇特別篇。 除了漫畫第594話《逃亡者》（也是劇場版《異次元的狙擊手》特典）動畫化，也加入了「堤无津川风筝事件」伏筆（动画原创）。 第491話至第504話的紅與黑的碰撞系列故事，是目前名偵探柯南漫畫以及電視動畫最長的系列故事，長達動畫14集。 漫畫第594話「逃亡者」原本未被改編為电视動畫，並與第23首片頭曲大致相同，之后于2014年被改编为手机电视动画，作为剧场版《异次元的狙击手》的特典，並在NOTTV播出，其內容也有一部份是原創內容。
在后期的访谈裡石原坦言“女孩子之间的关系和友情”，他其实并不太擅长，为此山田的女性视角弥补了石原的男性视角的不足，让这一方面有了更加正面与接近真实的描绘。 此外《吹响》的故事发生就发生在京都动画公司本社所在位置的附近，公司内部部分社员也有制作以京都为舞台的作品的想法。 2018年，規劃將有2部動畫電影依次上映，動畫電影《莉茲與青鳥》、《吹響吧！上低音號 ～誓言的終章～》已分別於2018年4月21日、2019年4月19日在日本上映。 2013年12月5日，宝岛社出版发行了该系列的首作《吹響吧！上低音號～歡迎加入北宇治高中管樂團～》[注 1]。
2015年3月5日，小說第2卷《吹響吧！上低音號2～北宇治高中管樂團的最熱的夏天～》發行。 同年4月发行第3卷《吹響吧！上低音號～北宇治高中管樂團最大的危机》，6月《北宇治高中管樂團的秘密故事》发行。 之后分别于2016年10月6日出版续作《吹响吧！上低音号～波乱的第二乐章》前后作在于2017年9月与10月发表。
儘管劇組在「黑暗組織十億元搶劫事件」（第128話）補充了原本应在第 「奇怪的尋人事件」（第13話）中被刪除了有關宮野明美的劇情，但由於錯誤控制角色的服刑時間以及更換聲優由此導致劇版中出現了兩位廣田雅美/宮野明美。 之後劇組在特別篇「Episode One：變小的名偵探」中才修復了該錯誤。 「新幹線大爆破事件」和「奇怪的尋人事件」原作中有關黑暗組織的人物、情節，在動畫版被刪除，改為與組織無關。
之后公布将于2018年將順次上映完全新作的电影《莉茲與青鳥》、《吹響吧！上低音號 ~誓言的終章~》。 此后，于2019年6月1日，京都动画宣布一个关于久美子三年级故事的新动画企划正在进行。 片尾STAFF名單中，原畫一職下出現半扇門的名字。 經過確認，為無錫半扇門動畫加入柯南電視動畫制作。 這也是繼6月份《覆仇者（後篇）》由首次由中國大陸外包公司承擔大規模原畫制作工作之後，第二家中國制作組加盟《名偵探柯南》TV動畫原畫制作工作。
特典中有訪談、卡拉OK、原畫設定、特別版動畫等等，主要與「劇場版」有關；除了訪談一些藝人之外，也會有相關的劇情。 2.截至目前，部分海外代理商版集數（又稱為拆分版集數）仍將把1小時至2.5小時的特別篇拆分成30分鐘為1集，因此集數會多於日本所編列集數。 注意：1.下列內容包含「番外特別篇」、不定期播放《神偷怪盜》、《名偵探柯南：警察學校篇》系列，除《名偵探柯南：警察學校篇》外均不列入《名偵探柯南》集數計算。 2001年，小學館開始進行「旅遊篇」的特別計畫，每年約製播1個單元的旅遊特別篇，描述主角們在日本各地遊玩時發生事件的情景，在解謎的同時亦會介紹當地風景名勝、文化特色。
其演奏實力在高中生中出類拔萃，自己也對音樂相關事務要求嚴格，但不善於人際關係。 暗戀瀧老師，也因此無法忍受別人說他的壞話，但同時亦對久美子有超越一般同性朋友的情感。 後來，久美子虽因自身爱好和麗奈加入了北宇治高中管樂團，但等待她的却是曾经管樂團强校的末路。 虽学生大都以“晉級全国大賽”为目标，在顾问瀧昇的指导下从早到晚练习，惟实问题不断。
- 本集原畫組由4tune外包制作，這也是《名偵探柯南》TV動畫史上首次由中國大陸外包公司承擔大規模原畫制作工作。
- 除了漫畫第594話《逃亡者》（也是劇場版《異次元的狙擊手》特典）動畫化，也加入了「堤无津川风筝事件」伏筆（动画原创）。
- 2016年底，為了紀念「名偵探柯南20週年動畫&劇場版」，在週刊少年SUNDAY上公布特別篇「名偵探柯南 Episode”ONE ”變小的名偵探」播放消息，並在當年12月9日於「金曜日RoadShow」上播出。
- 2016年4月23日劇場版動畫電影公開上映，內容為電視動畫的總集篇。
- 亦避免動畫版全面追上漫畫進度，導致影響青山剛昌的創作，故不定期排定數位重播。
- 儘管劇組在「黑暗組織十億元搶劫事件」（第128話）補充了原本应在第 「奇怪的尋人事件」（第13話）中被刪除了有關宮野明美的劇情，但由於錯誤控制角色的服刑時間以及更換聲優由此導致劇版中出現了兩位廣田雅美/宮野明美。
相信此部還將延續票房大賣走勢，期待再創票房佳績。
在《名侦探柯南》不定期播放，實際上劇情改編自《神偷怪盜》。 日本官網以及現在國內大多數字幕組不列入集數，但中國大陸的豬豬字幕組（已經應版權方要求下架）卻列入集數計算。 這集的劇情有兩個問題；一是因劇組更改順序因素，此集在漫畫版為柯南第二次麻醉園子做推理（首次麻醉園子為漫畫第5卷，動畫第35話）。 當時柯南原先想麻醉小蘭做推理卻誤射園子，只好順水推舟。
久美子在初中時對同是管樂團成員的高坂麗奈失言，因而一直耿耿於懷，更為此而選擇了很少同學升讀的高中。 久美子进入北宇治高校，然而開學首日中，她听见北宇治管樂團的演奏却是不濟。 本來打算一切重新開始的久美子，卻在參觀管樂團練習時再次遇見麗奈。 “相棒劇場版2”是“相棒”系列上映10週年紀念作。 前作《相棒：鑑識米澤守事件簿》上映日期恰逢五一黃金週，因此前作僅用了5天時間便創下觀影人數破百萬的記錄，總票房高達44億4000萬日元(約合人民幣3.57億)。
