武裝方面，本機頭部兩側內藏了近接防禦機關砲MMI-GAU26 17.5mmCIWS，實體彈式的火器。 比前期第二世代系列的20mm更加小徑化，裝彈數得以增加，並通過彈芯改良抑制了殺傷力的下降。 主武裝MA-BAR73/S 高能量光束步槍，為前期第二世代系列光束步槍的改良型，速射性與射角優秀，性能均衡的中距離戰鬥用光束步槍。 通過改良對應Hyper Duetrion引擎豐沛的電力供給，實現了出力和連射性的大幅提升。 本機獨有的MMI-X340 「掌中槍」掌部光束砲，裝備於兩手掌部，可說是暗器的光束砲。
機能愈是增加，系統管理也愈是複雜，通過電子設備的強化，駕駛員得以不被打擾，細膩地控制機體遂行戰鬥。 左背面裝備了M2000GX 高能量長射程光束砲，破壞力與精準度兼具的大型光束發射管。 來自Hyper Duetrion引擎豐沛的能量供給，不僅高威力、長射程，連射性能也很優秀。
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裝備於雙手背部的X2351 「隔絕光」光束盾發生裝置，改良自亥伯龍鋼彈的「單相光波防禦盾」。 無論光束兵器、實體彈均可遮斷，能夠將破滅鋼彈的大出力光束完全無效化，防禦力凌駕於傳統施以對光束塗層的實體盾。 即便展開中也能從盾的內側攻擊，可任意調整展開形狀與面積，適合全方位使用，光束接觸敵機的同時用於攻擊或作為光束砲射擊也是可以的。 本機仍攜行一面反光束盾，這是考慮到本機經常衝擊砲火兇猛的敵陣，可能遭遇某些光束盾無法抵禦的攻擊（施以對光束塗層的物體可穿透光束盾），以及突破要塞的光束盾。
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包括控制介面在內的設備類都是高端化的，維持了同第二世代系列駕駛艙相近的配置，因此真‧飛鳥即使初次搭乘也能夠毫無困惑地操作。 右背面配備一柄MMI-714 「亞隆戴特」光束巨劍，為巨劍型外掛裝備的「石中劍」鐳射對艦刀的改良型，名稱的由來則是圓桌武士之長‧蘭斯洛特的愛劍。 通過巨大的實體刃與光束刃如斬馬刀般輕易破壞艦艇，甚至能將破滅鋼彈一刀兩斷。 擁有繼承自「石中劍」的高銳利度，作為格鬥戰用兵裝有著破格的威力。 具有如此長、大的刀身，可預料到平衡性絕對談不上良好，駕駛員須有相當的技術方能操控自如。
原本觀星者鋼彈所搭載的同名技術是接收太陽風及各種鐳射或荷電粒子，通過能量轉換得以利用光壓推進，兼具作為鐳射推進的一面。 導入此技術的其他軍用MS，則是利用機體內的雷射發送器，並搭載了動態的瞬間加速力優秀的模組。 而本機也是通過特殊的能量轉換，獲得強大的光壓作為推進力，來自Hyper Duetrion引擎供給的無限電力形成巨大的赤色光之翼，發揮出無與倫比的超加速。 同時廣域散佈幻象化粒子，在周圍的空間上形成自機的光學殘像，使敵人在視覺上、電子上均無法捕捉，本機壓倒的機動性已成為同時代MS的最強級別。 在原作中以主角新機體的登場順序來說命運鋼彈是第一機，日本官方網站也是率先釋出這台眾所期待的「主角機」，結果卻引來許多資深鋼彈迷的批評。 首先就是命運鋼彈的「光之翼」被指控剽竊U.C.系列的V2鋼彈，「掌中槍」亦被批評抄襲《G鋼彈》的「閃光掌」。
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再者，有人質疑命運鋼彈僅失去雙手和右足便再起不能，反觀過去自由鋼彈、脈衝鋼彈等曾受到更嚴重的損傷，卻依然能夠繼續行動。 本機搭載最新型動力機關Hyper Duetrion，多樣的強力兵裝均獲得了巨大出力，即便沒有外部裝備仍擁有恐怖的總體性能。 此外，更統合、高性能化脈衝鋼彈原有的威力型外掛裝備、巨劍型外掛裝備與轟擊型外掛裝備各武裝並成功裝備之，在任何戰鬥距離中都能發揮出壓倒敵機的最大攻擊力和驚異機動力。
- 請幫助改進這個條目，使用中立的語氣（而不是愛好者或媒體報導的語氣），移除瑣碎的軼事與未經證實的評論、不合適的列表和連結收集等。
- 武裝方面，本機頭部兩側內藏了近接防禦機關砲MMI-GAU26 17.5mmCIWS，實體彈式的火器。
- 本機背部的飛翼部件是從自由鋼彈的活動空氣動力彈性翼（Active Aeroelastic Wing）發展而來的產物，無論大氣圈內或宇宙空間均能發揮絕大機動性。
- 另外也存在其他擁有變形機構的武裝，不過都沒有複雜化到如此程度的。
- 令人誇耀的是不只對艦戰、對要塞戰，對MS戰亦有很高的運用性，而且無須手持也可展開使用。
命運鋼彈以最新型兵器對抗舊的第二世代系列兵器卻未有優勢的還有一例。 最終戰的最後，命運鋼彈以掌部光束砲「掌中槍」接下無限正義鋼彈的光束軍刀「超蠍式」。 按照設定，超蠍式的性能僅與第二世代系列（脈衝鋼彈等）的光束軍刀「金剛杵」相當，掌中槍的出力應強於超蠍式；即便做不到反壓制，至少相互抵消是沒有問題的。 可是命運鋼彈不知何故被安排以手指去握住光束刃，然後發生不明爆炸而失去雙手。 有人推測該爆炸可能是手掌被切斷的瞬間，手掌內部的掌中槍相關元件和電路遭到正在發動的光束能量破壞所引發。
盾是比較小型的規格，但與脈衝鋼彈的機動防盾同樣具有可擴大防禦面積的伸縮機構，兼顧良好的靈活性。 以輕量且超高硬度的特殊金屬製成的對光束塗層防盾，亦可和光束盾並用。 本機搭載的新型Hyper Duetrion引擎，為核引擎與氘核系統的混合動力，兩套發電機相互補完下，理論上沒有缺電問題，能夠發揮出既往動力機關數倍之出力。 同時採用了新型的駕駛艙，外景顯示器通過前方及側邊面板的無縫一體化，實現了高辨識度的廣域視界。 操作系統亦採用新型的「MOBILE SUIT NEO OPERATION SYSTEM Ver.1.62 Rev.29 」，能夠順暢地運行各種先進化裝備群。
其性能遙遙凌駕於包括轟擊型外掛裝備在內、既有的MS用光束發射器。 令人誇耀的是不只對艦戰、對要塞戰，對MS戰亦有很高的運用性，而且無須手持也可展開使用。 發砲時展開22米的砲身超越機體的身長，應用了機體本體亦採用的基本構造細分割化與連動滑行機構，不使用時砲身折疊起來裝備於左後背的武器架台。 另外也存在其他擁有變形機構的武裝，不過都沒有複雜化到如此程度的。
還有背部的「高能量長射程光束砲」，其掛載形式與發砲動作被人認為模仿鋼彈F91的VSBR砲（儘管C.E.系列不少機體如轟擊型脈衝鋼彈、救星鋼彈和曉均有類似武裝）。 除了對艦刀與光束迴旋鏢較有SEED風格之外，其他武裝均有被認為抄襲了U.C.系列歷代鋼彈最強武裝的說法。 因此命運鋼彈又被部分資深鋼彈迷稱為「福田監督偉大的抄襲之作」，甚至還被冠上「最強合成獸」的稱號。 似乎是有自知之明，官方後來追加了「命運鋼彈的整備性有很大問題」的設定來概括疑問。
本機五體的柔軟度更是不可或缺的，換作其他機體，即便裝備了也無法使用。 不過亦有人認為，若不借鑒U.C.系列的傳統，那麼C.E.又如何與當初發展繼U.C.之後「21世紀的新鋼彈系列」的原旨相符？ 沒有致敬、沒有浮游兵器、沒有特殊裝甲…完全的原創是否能稱得上鋼彈？ 《OO劇場版》更創下鋼彈史上最絢麗的光束齊射，顯然官方認同這些都是鋼彈的特色。 本機背部的飛翼部件是從自由鋼彈的活動空氣動力彈性翼（Active Aeroelastic Wing）發展而來的產物，無論大氣圈內或宇宙空間均能發揮絕大機動性。 而機翼的內部，更搭載了技術轉移自行星間航行用推進系統「光輝傳遞者（Voiture Lumiere）」的高推力推進器。
沒有架設光束砲的動作就能發動攻擊，交會的接近戰鬥也相當好用，可確實破壞密著狀態下的對手，亦有作為光束短劍的機能。 實現「以MS戰鬥運用的全新創造」，本機獨自新機軸的兵裝之一，故戰術的變化也是未知數。 新機體開發之際，杜蘭朵議長提出了「將最高技術全都盛滿進去」的要求，這有著使用核引擎、幻象化粒子等為尤尼烏斯條約所禁止的各種技術的意味在，本機也實際用上了以這些技術發展出的裝備。 另外，不僅僅是這些既有技術的發展轉移，可說是「以MS戰鬥運用的全新創造」的本機亦大量採用了獨有的系統。 面對規模、物量佔絕對優勢的地球聯合，P.L.A.N.T.不能重蹈前大戰陷入持久戰泥淖的覆轍。
然而，幾乎採用了同樣動力機關與關節機構的攻擊自由鋼彈卻不存在這些問題，令更多人相信以上問題只是福田監督為了劇情需要而無視設定與邏輯的矛盾演出。 左右肩側配備了兩支RQM60F 「爍刃二式」光束迴旋鏢，為巨劍型外掛裝備的「爍刃」光束迴旋鏢的發展型，主要用於投擲攻擊。 導入了簡易式龍騎兵系統（DRAGOON System），可依照駕駛員腦中描繪的弧形軌道飛行，延伸光束刃的輸出長度作為手持式的光束軍刀使用也是可以的。 另外，，取消了兩刀連結的機能，新增了可作為實體刃迴旋鏢使用的原創機能，亦可作為手持實體刃。
札夫特企望結合最強MS與駕駛員的部隊，能夠一舉擊潰地球聯合的戰力，迅速使其喪失戰意。 於是產生了從各地戰線集合戰績優秀的王牌駕駛員，建成有效運用以命運鋼彈為主力MS的特殊部隊「Concluders」的構想。 本機原本應該擁有標示著搭載核引擎的型號「A」，超越第二世代系列（Second Stage Series）的第三世代系列（Third Stage Series）定位。 然而，當時尤尼烏斯條約已形同具文，搭載核引擎看上去沒有問題，但仍出於政治理由隱匿了這個事實。 為此將「A」從型號中削除並附加了表示第二世代系列的「S」代之，號碼則分配了一直是缺號的「4」。
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