2015年9月16日，facebook「大圍聯盟」群組於15日晚上載一張照片，一名身高約1.6米、身穿校服的女學生，背著一個與她身高相約的古箏，站在港鐵大圍站。 當時，她正被3名港鐵職員包圍，疑因攜帶體積大的深啡色古箏盒，而遭截停查問。 有網友指，事件發生於傍晚6時許，該名女生被指古箏太大，不獲進入月台。
機場鐵路香港站設計核心概念是利用適宜的自然光線以及清晰的空間佈局，創造通透流動空間以引導遊人。 這個概念於市區預辦登機大堂之客務中心得以展現，通過四層高的大堂，幕牆及天窗引入天然光線，營造了極具特色的空間，使光線進一步滲透到大堂每一個角落。 商店及其他輔助設施設於四層裙樓內，連接著行人天橋系統到達上蓋設施及附近商業辦公樓。 因沙田至 中環綫工程竣工後馬鞍山綫將與西鐵綫併合為屯馬綫，並統一以八卡列車營運，港鐵公司於2013年展開此站月台延長工程，新建部分已於2016年11月20日起開放使用。 為疏導尖沙咀站大堂南端、麼地道行人隧道交匯處以及加拿分道路面的人流，港鐵公司計劃在D出口位置加建一條長約80米的行人隧道，並增設D3出口連接K11購物藝術館地庫二層以及同時重建D1、D2出口。
港鐵地圖: 車費結構
然而，各項發展計劃遇到不同程度的延誤，使原定的通車時間一再延遲。 港鐵現時向九廣鐵路公司租借了154輛空調特低地台巴士，營運接駁東鐵綫的港鐵接駁巴士，及於新界西北提供接駁和輔助輕鐵及西鐵綫的巴士服務。 車隊包括亞歷山大丹尼士Enviro 500、富豪B9TL、亞歷山大丹尼士Enviro 500 MMC、亞歷山大丹尼士Enviro 200 Dart及亞歷山大丹尼士Enviro 400型巴士。 2011年8月6日下午1點半時，東鐵綫近大埔墟站的信號系統發生故障，有乘客投訴由粉嶺前往大埔墟3個站之間，列車停頓3、4次，延誤近10分鐘。 其間車站內有廣播，亦有車務調動，部分北行往羅湖方向列車要改以沙田為終點站。
繼承原有九廣西鐵/西鐵綫及馬鞍山鐵路/馬鞍山綫車長執行月台職務的傳統。 車長在關上車門及月台門時，會走出駕駛室，確保所有門關上，且沒有乘客或任何物品被夾住，再進行指差確認，方會返回駕駛室。 TAW臨時車站於1983年8月15日啟用，現有車站於1986年4月23日啟用，當時稱為馬鞍山鐵路／馬鞍山綫／屯馬綫一期的部分則於2004年12月21日方啟用。 港鐵地圖 三款全月通加強版只在前一個月最後7天至該月首7天發售，乘客可於月票適用範圍的屯馬綫車站非付款區客務中心、售票增值機（顯徑站、啟德站、宋皇臺站及土瓜灣站）購買，只收現金。
港鐵地圖: 香港鐵路網絡圖
當餘下6列近畿川崎列車完成重編工程後，全綫用車數量將增加至65列。 ，是由既有的西鐵綫（2003年12月20日通車）與馬鞍山綫（2004年12月21日通車），連同居中新建的沙田至 中環綫「大圍經九龍東至紅磡段」併合而成，形成一條經九龍半島連貫新界東與新界西的策略性鐵路走廊。 隨2021年6月27日啟德與紅磡之間的一段鐵路通車，「屯馬綫」亦吿全面啟用，正式成為港鐵網絡的其中一條鐵路綫。 65歲或以上長者使用長者八達通或個人八達通（包括「樂悠咭」）及合資格殘疾人士使用「殘疾人士身分」個人八達通乘搭機場快綫，有關車程將收取成人八達通車費；而往返羅湖站及落馬洲站的車程及東鐵綫頭等額外費。
港鐵在記者會上指出，不能攜帶含有酒精成份的消毒劑或消毒噴，以及含酒精成份的搓手液登上高鐵，港鐵建議乘客改帶消毒濕紙巾，乘坐高鐵亦必須佩戴口罩。 港鐵地圖 同時乘坐高鐵出行的市民，須持有出境前48小時進行的核酸檢測陰性報告，先可以入境國內。 另外亦有網友指出，其實最簡單上攜程的香港版網站 Trip.com，亦可以快速訂到香港高鐵車票，更無需這麼煩註冊。 列車車門上方設有動態路綫圖；車卡連接位上方亦有顯示屏，顯示下一站和目的地。
港鐵地圖: 機場巴士
早上10時36分，即工程人員經搶修超過10小時後，東鐵綫服務陸續恢復正常。 港鐵地圖 2019年3月24日凌晨零時許，東涌綫一列開往香港站的列車，行駛途中因架空組件鬆脫，令車頂的集電弓墮下，列車慢駛至欣澳站停下。 受事件影響，機場快綫來往香港站和機場站的列車服務暫停，來往機場站及博覽館站，維持15分鐘一班車，市區預辦登機服務現已暫停。 東涌綫來往香港站至欣澳站列車服務維持10分鐘一班車，來往欣澳站至東涌站列車服務暫停。 港鐵常務總監金澤培連同車務總監劉天成表示今次故障是自90年代後期營運以來從未發生過，會成立調查委員會調查事件，同時會選擇一天為乘客提供半價乘車優惠。 10月29日，港鐵在11月3和4日（周六和周日）推出優惠，以感謝乘客故障期間的體諒。
為方便乘客選擇合適的月台登車，港鐵加設全新乘客資訊顯示屏，指示車務安排與列車班次資料，讓乘客在車站大堂及月台清楚知道列車開出的時間及所停靠月台。 此外，港鐵亦會於月台作出廣播，通知乘客列車前往的目的地。 紅磡站車站套色為洋紅色，主題植物為洋紫荊，街景繪圖則描繪紅磡站C出口暨直通車大堂和香港體育館外觀。
港鐵地圖: 車站結構
而龍門居、富健花園及新屯門中心的乘客，日後能轉搭輕鐵前往屯門南站轉車。 共使用59列8卡列車，包括42列近畿川崎列車及17列中國製列車。 前者由九廣鐵路公司擁有，於兩鐵合併後租予港鐵使用；後者則由港鐵購買及擁有。
- 可是東鐵綫的本地客運大幅擴張，使直通車不論增加班次或縮短行車時間上都遇上困難，可能要等待廣深港高速鐵路通車方有改善。
- 觀塘綫延綫將原有觀塘綫向東南延伸，共設2個車站：何文田站及黃埔站。
- 全長一公里的尖沙咀支綫由紅磡車站沿梳士巴利道地底往返尖沙咀東部。
- 每個維修車廠除了負責為相應行車綫的電動車組提供電力外，亦設有停車設施、洗車設施與預防及糾正性維修設施，例如更換重型設備時用的起重及頂升設備。
- 有目擊者指出，車站職員曾暫停列車行駛，走入路軌嘗試驅趕唐狗，擾攘約6至7分鐘後，卻未能成功將唐狗帶離路軌，但車站職員仍重啟列車服務。
- 尖東站大堂位於梳士巴利道地底，南面位置為收費區，設有多組扶手電梯、樓梯以及2部升降機連接月台。
例如由屯門前往荃灣收費$21.5，但前往荃灣西只需$14.5，兩者路面距離相若但相差$7。 因為這樣更會出現短貴長平的現象，例如鑽石山前往何文田收費$10，但多一站前往紅磡只需$7。 這是因為港鐵票價定價主要考慮乘客付費能力以及巴士服務競爭，而非成本。
港鐵地圖: 車站佈置
本地客運自此後至九龍南綫通車前，只佔據用兩個月台島之間的2號及3號月台，分別服務東鐵北行和南行列車，4號月台用作停泊閒置列車或以此站為終點站，而1號月台路軌更一度停用。 紅磡站在啟用後一直稱為「九龍車站」（Kowloon 港鐵地圖 Station），到九十年代九廣鐵路公司更新企業形象時，則改名為「紅磡車站」（同時九廣鐵路改稱九廣東鐵）。 至於為何易名為紅磡，其中一個說法是指避免與即將開通的東涌綫暨機場快綫九龍站重名。 事實上，1994年《鐵路發展策略》建議九鐵興建尖沙咀支綫的同時，顧問公司已提出將九龍車站正名為紅磡。 為配合紅磡站發展，九鐵於1990年計劃興建中層大堂；其後於擴建車站時部署增建，方便乘客往來尖沙咀及海底隧道巴士站之天橋，以縮短步行距離。
為進行跟進修復，控制中心宣佈暫停東鐵綫全線列車服務，包括城際直通車也停駛。 故障期間港鐵加派接駁巴士疏導受影響乘客，惟指示不清晰引起混亂。 在粉嶺站及火炭站曾有乘客被困車廂良久但得不到任何救援下打開車門沿路軌離開。 後來港鐵調查發現故障源於訊號系統發出有問題指令，估計屬軟件運作有問題。
港鐵地圖: 港鐵路綫圖
《中國好聲音》香港區冠軍、音樂人劉卓軒於2015年9月26日晚在港鐵觀塘站，近APM商場出口的行人天橋唱歌，被港鐵職員阻止，港鐵職員其後報警。 港鐵地圖 音樂人自稱是測量師，質疑該地屬公共空間，指職員無權干涉。 翻查地政署資料，創紀之城第五期連接港鐵站出口、橫跨觀塘道的行人天橋「位於政府土地」。
2017年4月10日傍晚約6時，觀塘綫彩虹站至九龍灣車廠的軌道電纜裝置在下班繁忙時間出現故障，起初暫停觀塘站至彩虹站之間服務，其後工程人員需要擴大檢查範圍，佔用更多路軌，導致服務中止範圍由彩虹站延長至九龍塘站。 有列車於九龍灣站至彩虹站之間的隧道故障停下，用了近2小時才可將所有乘客經路軌疏散至月台；部份列車照明系統局部暫停，空調亦暫停，多人不適甚至暈倒，要用氧氣罩協助呼吸，共有8人送往聯合醫院。 由九龍塘至黃埔站班次減至10分鐘一班，來往觀塘至調景嶺站更需12分鐘一班。 港鐵安排接駁巴士接載乘客來往九龍塘至觀塘站，共5,000多人乘搭。
港鐵地圖: 使用車輛
2006年4月11日，香港政府和香港地鐵有限公司達成有關地鐵和九廣鐵路合併的共識，其後行政長官會同行政會議通過兩鐵合併方案，政府和地鐵亦簽署了兩鐵合併諒解備忘錄。 備忘錄內容包括地鐵租用九鐵網絡50年的服務經營權、購入九鐵公司的物業資產發展權，並會對車務結構進行調整、提供更方便的轉綫安排等。 兩鐵合併曾引起廣泛爭議，有人認為合併後產生的協同效應可節省成本及營運開支，並能取消轉乘車費。
2020年11月12日，會展站平頂，意味著「紅磡至金鐘段」的土木工程大致完成。 車站隨即正式展開軌道鋪設工程、機電工程及其他後期裝修工程。 根據1994年發表的《鐵路發展策略》，北港 島綫設於會展附近的車站乃一中型鐵路車站，命名為「會展中心站」（Exhibition Centre Station），並同時作為南港島綫終點站。 至2000年發表的《鐵路發展策略2000》，會展站（Exhibition Station）的名稱和發展細節才與最終定案相似。 為了讓廣大市民能夠便捷地查閱政府的數碼地圖和地理空間信息，地政總署開發了供公眾使用的「地理資訊地圖」服務。
港鐵地圖: 將軍澳綫
香港站市區預辦登機服務大堂（G）、商店及餐廳（L1）、機場快綫月台（L1）、東涌綫大堂（L3）設有由電訊盈科免費提供嘅Wi-Fi熱點，乘客可以喺等車時用手提電腦或個人數碼助理（PDA）上網。 港鐵地圖 另一方面，由於機場快綫大堂係為旅客而設，因此市區預辦登機服務大堂及機場快綫大堂非收費區設有公眾洗手間，而機場快綫月台嘅收費區內，更設有手提電話叉電器。 香港站有7-Eleven便利店、麵包糕餅店、快餐店、咖啡店、書店等零售業同埋恒生銀行、醫務所及行李寄存等服務。 此外，香港站亦有唔少自助服務設施，包括恒生銀行同中國銀行（香港）嘅自動櫃員機、自動售賣機、自動照相機等。 車站內更設有香港郵政郵箱及「iCentre」免費上網服務設施，方便乘客喺車站內寄信同上網。 港鐵地圖 車站更設有「e分鐘著數」機，畀乘客買網上服務同享用港鐵友禮會嘅會員優惠。
港鐵地圖: 使用狀況
而且該字體雖然橫筆細，但關鍵的豎筆卻很粗，所以當作指示，並不會有看不清楚的問題，只要再把橫線加粗，就更好了。 其後地鐵公司在1982年3月製成「指標規範手冊」，作為日後指示設計的準則。 雖然單程票經營成本比電子收費更高，但港鐵利用大多市民已經習慣使用八達通電子收費模式，現時輕鐵有70個車程組合（約0.15%）更出現使用單程票，收費比八達通更低情況。 有別於一些單一票價的鐵路系統，港鐵收費並非劃一，票價收費亦不是根據路程長短而定，轉線次數亦有機會影響票價，票價的高低亦同時取決於乘車等級以及是否涉及合併前的不同網絡。
