类似于PBS中的qsub lsf -I，为了防止滥用（开了之后长期不关等）交互模式，目前只允许在interactive队列使用交互模式，且时间限制为48h，超时会被杀掉。 lsf 这里写了一个跑RNA-Seq流程的example，主要是2个脚本，RNA.sh lsf 为具体处理每个样本的流程脚本，在batch_run.sh 对每个样本都提交运行RNA.sh脚本。
- LSF（Load Sharing Facility）是IBM旗下的一款分布式集群管理系统软件，负责计算资源的管理和批处理作业的调度。
- 非root用户只能查看、删除自己提交的作业。
- 如果使用不同的MPI库，可能需要明确指定MPI的数量 以这种方式在命令行上进行处理。
- LSF 具有良好的可伸缩性和高可用性，支持几乎所有的主流操作系统。
- 它通常是高性能计算环境中不可或缺的基础软件。
- 如果用户要在作业提交后终止自己的作业，可以使用bkill命令，用法为bkill jobid。
它给用户提供统一的集群资源访问接口，让用户透明地访问整个集群资源。 LSF 具有良好的可伸缩性和高可用性，支持几乎所有的主流操作系统。 它通常是高性能计算环境中不可或缺的基础软件。 使用系统范围的intelmpi / openmpi时，可以省略-np $ lsf LSB_DJOB_NUMPROC命令，因为程序会自动获取有关核心总数的信息。 如果使用不同的MPI库，可能需要明确指定MPI的数量 lsf 以这种方式在命令行上进行处理。
lsf: LSF基本介绍和使用
在此建议将流程中的主要运行步骤直接用bsub提交，按需要申请核心数、内存等，需要用上文中提到的bsub的 -K 参数。 如果用户要在作业提交后终止自己的作业，可以使用bkill命令，用法为bkill jobid。 非root用户只能查看、删除自己提交的作业。
多节点并行作业需要程序本身支持，使用mpirun等MPI命令运行，绝大部分生物软件不支持多节点并行。 如不确定程序是否支持多节点并行，请勿使用，避免资源浪费。 LSF（Load lsf Sharing lsf Facility）是IBM旗下的一款分布式集群管理系统软件，负责计算资源的管理和批处理作业的调度。
